คลินิกศูนย์แพทย์พัฒนาตั้งอยู่บนเนื้อที่ประมาณ ๒๔ ไร่ ริมถนนใต้ทางด่วนเอกมัย-รามอินทรา ช่วงพระรามเก้า โดยเส้นทางเข้าได้ทั้ง ถนนพระราม ๙ และถนนเลียบทางด่วน ปัจจุบันมี ๒ อาคาร เปิดบริการครั้งแรกเมื่อวันที่ ๕ ธันวาคม ๒๕๓๕ ส่วนอาคาร ๒ เป็นอาคารสร้างใหม่ เปิดให้บริการเมื่อวันที่ ๒๓ มีนาคม ๒๕๕๔ ทั้งนี้เนื่องจากอาคาร ๑ คับแคบไม่เพียงพอต่อการให้บริการให้คำแนะนำรักษาดูแลผู้ป่วย ทั้งโรคทั่วไป โรคเฉพาะทาง และทันตกรรม ที่มีจำนวนเพิ่มขึ้นอย่างมาก อย่างไรก็ตาม ศูนย์แพทย์พัฒนามีสถานะเป็นเพียงคลินิก จึงไม่มีการรับผู้ป่วยค้างคืน

ศูนย์แพทย์พัฒนาเกิดขึ้นจากพระมหากรุณาธิคุณของพระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัวภูมิพลอดุลยเดชฯ ที่ทรงมีต่อพสกนิกรทุกแขนงอาชีพ เมื่อครั้งที่ทรงทราบถึงความเดือดร้อนของชาวชุมชนที่อาศัยอยู่บริเวณคลองแสนแสบ คลองลาดพร้าวหรือคลองพลับพลา เนื่องจากน้ำในคลองดัวกล่าวเน่าเหม็น ทางรถเข้าออกมีทางเดียว คือ ซอยรามคำแหง ๒๑ เมื่อสุดซอยก็ต้องเดินต่อไปตามคันนาร้างอีกไกลจึงจะถึงที่ชุมชน โดยในปี ๒๕๓๑ ทรงมีพระราชดำริให้ กทม.นำน้ำเน่าในคลองลาดพร้าวมาบำบัดในบึงขนาดใหญ่ซึ่งทรงพระกรุณาโปรดเกล้าให้ขุดจากที่ดินของทรัพย์สินส่วนพระมหากษัตริย์ เมื่อบำบัดแล้วให้นำคืนสู่คลองดังเดิม และทรงเห็นว่า พสกนิกรเจ็บป่วยเนื่องมาจากสภาพแวดล้อม จะไปหาหมอก็ไกล ถนนหนทางลำบาก จึงทรงพระราชทานทรัพย์ส่วนพระองค์สร้างอาคารคลินิกศูนย์แพทย์พัฒนาขึ้น เพื่อเป็นสถานที่ให้การรักษา บนพื้นที่ ประมาณ ๑๐ ไร่ พระราชทานเครื่องมือแพทย์อันทันสมัย และจัดตั้งบริษัทบ้านบึงเวชกิจ จำกัด เพื่อบริหารงานในปี พ.ศ. ๒๕๓๕ ต่อมาได้พระราชทานที่ดินเพิ่มอีก ๑๔ ไร่ เพื่อสร้างอาคารที่ ๒ และเปิดใช้บริการในปี ๒๕๕๔ นี้เอง แต่เดิมนั้นแพทย์ที่รักษาจะเป็นแพทย์ที่ถวายการรักษาพระองค์จากสวนจิตรลดา (ข้อมูลจาก เว็บ md-center.org และ kanchanapisek.or.th) ปัจจุบันศูนย์แพทย์พัฒนามีแพทย์จากโรงพยาบาลต่าง ๆ มาให้การรักษา ศูนย์แพทย์แห่งนี้เป็นที่นิยมของผู้เกษียณอายุราชการ เนื่องจากไม่ต้องทนฝืนสังขารรอพบแพทย์เป็นเวลานาน ๆ เหมือนโรงพยาบาลของรัฐ แม้จะต้องจ่ายค่าบริการเพิ่มขึ้นบ้างก็นับว่าคุ้ม